中國科學院城市環境研究所成立于2006年7月4日，是目前國際唯一的專門從事城市環境綜合研究的國立研究機構。
戰略定位是面向國際環境科技前沿和國家生態文明建設、城鎮化戰略需求，圍繞城市環境健康、城市環境污染控制與修復、城市環境規劃與管理三大領域開展前瞻性系統研究；擁有科技部國際科技合作基地、國家級對臺科技合作與交流基地；中國科學院城市環境與健康重點實驗室、中國科學院城市污染物轉化重點實驗室、中國科學院區域大氣環境研究卓越創新中心等科技創新平臺。
截止2020年8月在職職工和研究生人數近700余人，其中包括中國工程院院士1人、中國科學院院士1人，國家杰出青年基金獲得者5人、國家優秀青年基金獲得者5人、科技部中青年科技創新領軍人才3人等領軍人才，已基本建成城市環境創新領域人才高地。已與美國、英國、德國、法國、日本、加拿大、澳大利亞、荷蘭、韓國等十多個國家及香港、臺灣的高水平研究機構保持著頻繁的交流和密切的合作關系，并與英國阿伯丁大學、美國佛羅里達大學、美國新澤西州立大學、香港理工大學等單位簽署了全面合作協議。
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